公司設立登記和合伙企業(yè)設立登記的區(qū)別主要表現(xiàn)在以下幾個方面：

　　1.成立基礎：公司是以公司章程為基礎，帶有法定性特征；而合伙企業(yè)則以合伙協(xié)議為基礎，帶有約定性特征。

　　2.法律地位：公司具有法人資格，有絕對的獨立人格；而合伙企業(yè)不具有法人資格，只有相對的獨立人格。

　　3.責任承擔：公司的股東對公司的債務承擔責任；而合伙企業(yè)的合伙人需對合伙企業(yè)的債務承擔無限的連帶責任。

　　4.財產(chǎn)關系：公司的財產(chǎn)具有完整性和獨立性，公司財產(chǎn)與股東財產(chǎn)是分離的；而合伙企業(yè)的財產(chǎn)具有不完整性和共享性，因為合伙企業(yè)的財產(chǎn)與合伙人的財產(chǎn)有一定的關聯(lián)性。

　　5.盈利分配和虧損分擔：公司除了公司章程的規(guī)定外，一般是按出資比例分配公司盈利；而合伙企業(yè)的盈虧一般是按合伙人協(xié)會來分配，或是合伙人之間平均分配。

　　6.稅收政策：公司需要繳納企業(yè)所得稅和個人所得稅，實行雙重征稅；而合伙企業(yè)只需繳納個人所得稅，實行先分紅后繳稅。

　　7.規(guī)范性：由于公司比較常見，相應的法律法規(guī)是針對公司的政策是比較多的，也就具備更好的規(guī)范性。

　　8.組織形式：注冊公司的組織形式由《公司條例》詳為規(guī)定，比較固定；而合伙企業(yè)的組織形式相對靈活，只要不違反法律，可由合伙人以協(xié)議決定。

　　9.合伙人資格：注冊公司包括一些并非以營利為目的的公司；而合伙則必須以營利為目的，不以營利為目的的數(shù)人之間可以形成另外一種非法人團體的聯(lián)合，但不能組成合伙。

　　10.解散與延續(xù)：注冊公司為法人，有永久延續(xù)性；而合伙則不是法人，隨合伙人喪亡而解散。

　　綜上所述，公司設立登記和合伙企業(yè)設立登記的區(qū)別主要表現(xiàn)在成立基礎、法律地位、責任承擔、財產(chǎn)關系、盈利分配和虧損分擔、稅收政策、規(guī)范性、組織形式、合伙人資格、解散與延續(xù)等方面。在選擇適用哪種企業(yè)形式時，需要綜合考慮多方面的因素。