北京公司搖號申請流程如下：

　　1.登錄北京市機(jī)動車搖號官網(wǎng)（注冊企業(yè)用戶）。

　　2.填寫公司基本信息、公司組織機(jī)構(gòu)信息、公司納稅信息及上一年度納稅額。

　　3.提交資料并等待審核。審核通過后，就可以參與搖號了。

　　請注意，每月26日可以登錄該網(wǎng)站查詢搖號結(jié)果。如果中簽，打印指標(biāo)證明后即可購車。

　　此外，公司需要滿足一定的條件才能參與搖號，如在北京名下沒有登記的小汽車，或應(yīng)報(bào)廢而沒有報(bào)廢的汽車等。具體申請條件請查詢北京市交通委員會官方網(wǎng)站或咨詢相關(guān)部門。

　　請注意，搖號政策可能會隨著時間和政策環(huán)境的變化而有所調(diào)整，建議在申請前仔細(xì)閱讀相關(guān)政策規(guī)定，以確保申請流程的正確性和有效性。